宣说药师神咒后，释迦佛又强调了咒语的威力，并殷勤嘱咐众生，认真持咒。经云：
尔时、光中说此咒已，大地震动，放大光明，一切众生病苦皆除，受安隐乐。曼殊室利!若见男子、女人有病苦者，应当一心，为彼病人，常清净澡漱，或食、或药、或无虫水、咒一百八遍，与彼服食，所有病苦悉皆消灭。若有所求，志心念诵，皆得如是无病延年;命终之后，生彼世界，得不退转，乃至菩提。是故曼殊室利!若有男子、女人，于彼药师琉璃光如来，至心殷重，恭敬供养者，常持此咒，勿令废忘。
佛经中记载，大地震动有三种情况，每种情况都有六种震动。第一种情况是佛入胎、出胎、成道、转*轮、舍性命、入涅槃时大地会发生巨大震动，以示祥瑞。第二种情况是佛运用神通力，可以震撼三千大千国土，使大地起伏变化，出现东涌西没、西涌东没、南涌北没、北涌南没、边涌中没、中涌边没，地皆柔软，令众生和悦。第三种情况是佛用法力使大地出现动、涌、震、击、吼、爆。种种震动，显示佛法的伟大，震撼大地同时，震撼众生的心灵，使众生弃恶从善，归信佛法。
药师佛的咒语一发，就震动了大地，足见咒语的威力巨大。震撼大地的同时，遍放光明。在药师佛智慧之光照耀下，众生一切病苦都可以得到消除，由此获得安稳和快乐。所以经文说：「尔时、光中说此咒已，大地震动，放大光明，一切众生病苦皆除，受安隐乐。」
「尔时」即药师佛发出咒语的那个时候。「受安隐乐」即享受安宁平稳的快乐。大地震动，消除的是众生的病苦，带给众生的却是心灵的安宁和快乐。
咒语既有如此威力，所以释迦佛教诫人们，当自己或亲人生病之时，持诵此咒。持咒前应沐浴、漱口，然后用病人吃的食物、药品或清洁的水，对着这些东西咒一百零八遍，再给病人吃。这样，病人一切病苦都能消除。所以释迦佛说：「曼殊室利!若见男子、女人有病苦者，应当一心，为彼病人，常清净澡漱，或食、或药、或无虫水、咒一百八遍，与彼服食，所有病苦悉皆消灭。」
持药师咒可以挽救病人于急难之中，没有生重病的人常持此咒，就能祛病延年，而且命终可往生到药师净土去。所以经文说：「若有所求，志心念诵，皆得如是无病延年;命终之后，生彼世界，得不退转，乃至菩提。」
「若有所求」指祛病延寿的要求，「皆得如是无病延年」，「如是」即指如其所求，无病无灾，「生彼世界」即生药师佛净土。
经文前面已经经过，药师净土与西方极乐净土一样，功德庄严，纯洁清净，无恶无苦，所以往生到药师净土后，也可以像在极乐净土一样不退转地修行，直到最终的彻底觉悟。即「得不退转，乃至菩提。」
法会上释迦佛殷切嘱咐大家，一定要诚心地、慎重地供养药师佛，坚持念诵药师咒。佛对文殊菩萨说：「是故曼殊室利!若有男子、女人，于彼药师琉璃光如来，至心殷重，恭敬供养者，常持此咒，勿令废忘。」
「至心」即以最大的诚心，「殷重」即殷切慎重。「废忘」即荒废、忘失。
综上所述，这段经文中，释迦佛告诉大家，就在药师佛在光中说完咒语的那个时候，大地震动起来了，而且普遍地放出大光明。光明照耀一切众生，使一切众生所有病苦全部消除，获得了身心安宁和稳定的快乐。
释迦佛又告诉文殊菩萨说：「假如有男子或女子，患了各种病，就应当一心为那病人念诵药师咒。替病人念咒时，必须洗澡漱口，保持身口的清净。然后用病人吃的食物、药品或清洁无虫的水，对这些东西持咒一百零八遍，再把这些给病人吃，这样，病人所有病苦都会全部消除。」
如果有人想祛病延年，只要以最大的诚心念咒，他的这一愿望就会得到满足。坚持念药师咒，命终之后，还可以往生到药师净土去，在那里可以不退转地继续修行，一直到彻底觉悟。以此之故，如果善良的男人或女人，对药师如来能诚心殷勤尊重，恭敬地供养，对此药师咒，就应常常受持念诵，不要废弃或忘记。(接下来请看本经文的第九部分「怎样获药师佛的庇佑」)
九、怎样获药师佛的庇护
1、药师法的修习方式
药师佛智慧无边，福德威神力无边，众苦充满的娑婆世界众生，如何才能得到药师佛的救助加被呢?要得到药师佛的救助，必须皈依药师佛，接受药师佛的教诫，修习药师法。所以法会上，释迦佛嘱咐大家念诵药师佛名号，供药师佛像，书写、传播、诵读药师经，还要供养弘扬药师法的法师，以修习药师法。经云：
复次、曼殊室利!若有净信男子女人，得闻药师琉璃光如来应正等觉所有名号，闻已诵持。晨嚼齿木，澡漱清净，以诸香花，烧香、涂香，作众伎乐，供养形象。于此经典，若自书，若教人书，一心受持，听闻其义。于彼法师，应修供养，一切所有资身之具，悉皆施与，勿令乏少。如是便蒙诸佛护念，所求愿满，乃至菩提。
诵持名号
「净信男子、女人」指有清净信仰的佛弟子或善根深厚的人们。「得闻」即指有可能、有机会听闻到。药师佛有十个名号，释尊这里只举「如来、应、正等觉」代表药师佛具备的「所有名号」。对药师佛所具的名号，能听任何一个，都是一种难得的因缘。善良的人们既有因缘听到了药师佛名号，就应经常念诵，所以释尊要求大家「闻已诵持」。经常念诵持久不忘，在紧急危难时刻，就可能忆念药师佛名号，得到药师佛的救助。八识田中有念佛的种子，可以生生世世不堕恶趣，即便因宿世恶业，堕入恶趣也会因忆念药师佛名号而获解脱。
念诵佛的名号为什么可以得护佑加持呢?因为佛与真如同在，是真理的体现，佛的法身永存，无时不在，无处不现。无论何时何地，只要念他的名号，佛就会有所知有所应。佛的名号是一种特殊信息，通过这种信息，念佛人和佛就沟通了。念佛人自性清净佛性与佛的法身相应，念诵中，自性清净佛性渐渐被证明，善根日增，智慧显现，念佛达一心不乱，即可与佛同在，与真如同在。真如是无欠无缺、无坚不摧的，念佛者与真如同在，一切外邪都无法干扰。与真理相应，与真理同在，以真理作后盾，还有什么比这更无所畏惧呢?这就是最大加持力。
现代心理学精神分析学派认为，人的潜意识在人的意识中占有统治地位，它能在不知不觉中支配人的行为。潜意识相当于唯识学中的藏识即第八识。念佛名号，可使佛的概念潜移默化地进入潜意识，即所谓八识田中种下佛性种子。反复念诵反复强化，即所谓不断熏种。潜意识中的佛的形象越来越鲜明，甚至在梦中也会出现;慢慢地自信心越来越充足，心情越来越舒畅，由此，便可远离一切恶事。经常念佛会产生有持无恐的心态，正气凛然，邪气何能干扰?这是加持力直接显现。
念佛名号也是一种心理自我暗示，能自我鞭策，促使人积极向上，积善成德。善业必感善果，必得善报，这也是加持表现。
所以，念诵佛的名号，无论你认识它的价值或不认识它的价值，都会对你的身心产生护持的作用。净土法门，重视念诵，无论修东方净土还是西方净土，坚持念诵定有效验。
持名念佛必须正心诚意，轻慢、怠惰与佛法不相应。既不相应，怎么能有明显的效果呢?所以念佛以前应沐浴盥洗，保持身心清净。
「晨嚼齿木，澡漱清净」，是念佛前净心准备。
